2024年3月15日发(作者：)
62
J
Mod
Urol,
Vol.
26
No.
1
Jan.
2021
-基础研
.*
基于
TCGA
数据库的肾嫌色细胞癌生物信息学分析
瞿根义
，
王佳威
，
徐勇
，
阳光
，
聂海波
，
黄文琳
，
汤乘
(中南大学湘雅医学院附属株洲医院泌尿外科
，
湖南株洲
412007
)
Bioinformatic
analysis
of
genes
related
to
chromophobe
renal
cell
carcinoma
based
onTCGAdatabase
QU
Genyi,WANG
Jiawei,XU
Yong,YANG
Guang,NIE
Haibo
,
HUANG
Wenlin
,
TANG
Cheng
(Department
of
Urology
,
Zhuzhou
Hospital
Affiliated
to
Xiangya
School
of
Medicine
,
CSU
,
Zhuzhou
412007
,
China
)
ABSTRACT
:
Objective
To
explore
the
Hub
genes
related
to
renal
chromophobe
cell
carcinoma
(chRCC
)
based
on
TCGA
database.
Methods
Dataset
of
chRCC
was
extracted
and
screened
from
TCGA
database.
The
differentially
expressed
genes
(DEGs
)
were
analyzed
with
edgeR
algorithm
of
R
software.
After
that,the
volcano
map
was
DAVID
and
STRING
onlinebioinforma+ic+oolswereused+oanalyzeandcons+ruc++hepro+ein-pro+einin+eracion
(
PPI
)
ne+eswere
screened
with
Cytoscape
software,and
survival
analysis
was
carried
out.
Results
A
total
of
1
850
DEGs
were
screened
out,in
cluding
760
up-regulated
genes
and
1
090
down-regulated
genes.
GO
enrichment
analysis,KEGG
pathway
enrichment
analysis
and
PPI
network
analysis
showed
the
top
10
Hub
genes
were
KNG1
,
AGT,CASR,SST,AGTR2
,
PMCH,GNG4
,
DRD2
,
MCHR2
and
SSTR3
.
Survival
analysis
revealed
that
only
MCHR2
was
significantly
correlated
with
overall
survival
(OS
)
of
chRCC
(P
#
0.05).
Conclusion
Based
on
the
TCGA
dat
abase,mining
of
the
10
Hub
genes
of
chRCC
will
help
t
o
unders
t
and
the
genesis
anddevelopmen
.MCHR2
maybecomeapo
enial
herapeuic
arge
andprognos
ic
marker
of
chRCC.
KEY
WORDS
:
chromophobe
renal
cell
carcinoma
；
TCGA
dat
abase
；
bioinformat
ics
；
differen
t
i
ally
expressed
genes
；
Hub
genes
摘要
：
/的
基于
TCGA
数据库肾嫌色细胞癌基因表达谱数据
，
探讨肾嫌色细胞癌发生的关键基因
。
12
从癌症基因图谱
(TCGA
)
数据库中提取及筛选肾嫌色细胞癌数据集
，
并利用
R
软件的
edgeR
算法对肾嫌色细胞癌的差异表达基因进行分析
，
随
后对差异表达基因进行火
山
图绘制
，并进一步结合
DAVID
和
STRING
在线生物信息学工具对差异表达基因进行调控网络分析
并构建蛋白质-蛋白质相互作用
(
PPI
)
网络
，
采用
Cytoscape
软件进行
Hub
基因筛选
，
最终对挖掘到的关键基因进行生存分析
。
结
4
通过分析共挖掘肾嫌色细胞癌差异表达基因
1
850
个
，
其中表达上调基因
760
个
，
表达下调基因
1
090
个
，
对差异表达基因
进行
GO
富集分析和
KEGG
通路富集分析
，利用在线生物信息学工具构建
PPI
网络
，
使用
Cytoscape
软件获取
PPI
网络中前
10
位
Hub
基因
，
分别是
KNG1
、
AGT
、
CASR
、
SST
、
AGTR2
、
PMCH
、
GNG4
、
DRD2
、
MCHR2
、
SSTR3
。
对上述
Hub
基因进行生存分
析
，发现仅有
MCHR2
与肾嫌色细胞癌的总生存率
(OS)
有显著相关性
(
P
V
0.05
)
。
结#
基于
TCGA
数据库挖掘肾嫌色细胞
癌
10
个关键基因
，
将有助于深入了解肾嫌色细胞癌发生发展的过程
，
MCHR2
有可能成为肾嫌色细胞癌潜在的治疗
靶点及预后
标志物
。
关键词
：
肾嫌色细胞癌
；
TCGA
数据库
；生物信息学
；
差异表达基因
；关键基因
中图分类号:
R737.
11
文献标志码:
A
DOI
：
10.
3969/j.
issn.
1009-8291.
2021.
01.
015
肾细胞癌
(renal
cell
carcinoma,
RCC)
是一种异
则是
nccRCC
第二常见的亚型
，
约占肾细胞癌亚型的
源性疾病
，
由透明细胞肾细胞癌
(clear
cell
renal
cell
4%
〜
5%
⑵
，
发病年龄多为
50
〜
60
岁
，
男女发病率无
明显差异旧
。
虽然有研究表明具有局部
chRCC
和
carcinoma
,
ccRCC
)
和非透明细胞肾细胞癌
(
non-
c
lear
c
ell
renal
c
ell
c
ar
cinoma,
n
cc
RCC
)
组成
(
1
)
。
嫌
胞癌
(
hromophoberenal
e
l
arinoma
%
hRCC
)%
收稿日期
：2020-03-25
修回日期
：
2020-09-04
基金项目
：
株洲市科技计划项目
(
No.
2019-001
)
通
信作者
：
徐勇
，
主任医师,研究生导师.
:
tigerhnll@
126.
com
作者简介
：
瞿根义
，
硕士学位
，
住院医师•研究方向
：
泌尿系肿瘤基础与
临床
.
：
qugenyi@126.
com
王佳威
，
硕士研究生在读•研究方向
：
泌尿系肿瘤基础与临
床.
:
wjwxdhys@126.
com,
系共同第一作者
ccRCC
的患者在
5
年生存率方面无显著性差异
(
P
=
0.
98
)
⑷
，
但是大部分
chRCC
的患者预后比其他类型
的
RCC
患者好
，
通常采取手术切除治疗即可达到满
意的效果
。
然而对于部分进展期
、
预后差的患者
，
往
往需要免
疫
治疗和分子
靶
向治疗等辅助治疗
。
目前
,
治疗
chRCC
的
靶
向药物疗效不是
十
分明确
，
药物依
旧处在临床试验阶段
，
需要长时间的观测
5
。
因此进
h
t
p
://
；
现代泌尿外科杂志
2021
年
1
月第
26
卷第
1
期
63
一步研究
chRCC
发病的相关基因
，
将有助于了解
筛选获取的关键基因进行生存分析
，
并构建
Kapla.
chRCC
的发病机制和
进展
，
并对寻找更加安全
有效的治疗
重的作用
。
厂
生存
，
从而
关键
胞癌患者总生存
与肾
胞癌
的表达
预后关系
。
使用
Log-rank
检验评估关键
与肾
J
TCGA
数据库作
表达谱数
前
最大的肿瘤基因
的生存差异,
，
具有大样本和
的
提
中所含的
临床数据的
P
V
0.05
为具有统计学意义
。
2
结
果
2.
1
肾嫌色细胞癌差异表达基因筛选该研究从
物
学则是将分子生物学和电子计算机相结合
确的方向
，
帮助揭
。
本
的技术
，
可
示大
物
用生物信
片数据息学技术对肾
胞癌的发病相关
，
并进行
TCGA
数
中
、
整理及分析了
89
例肾
］
细
胞癌
的
数
，
中
65
肾
胞
癌
样
本
进行整合和分析
，
筛选出差
制作
PPI
互作
集
(gene
ontology,
GO)
分析和
KEGG
通路富集分析
，
，
以求寻找肾嫌色细胞癌发病及
和
24
样本
，
利用
R
件进行差异表达基
因筛选
，
以
P
<
0.
05
且差异倍数
2.
5
倍为显著差异
获取差
表达
。
共
筛
出
肾
胞
癌
差
表
达基因
1
850
个
，
其中表达上调基因
760
个
，
表达下调
发展的关键
分析
，
为进一步
物基础
。
，
最终对
的关键
进行生存
机制奠定生
肾
胞癌的
基因
1
090
个,并绘制火山图(图
1)
和差异最显著的
1
材料与方法
1.1
材料
在
TCGA
Datasets
(http
：
//www.
ncbi.
前
50
个基因热图(图
2
)
。
nlm.
nih.
gov
/
geo
)
数据库
中以
“
chromophobe
renal
cell
carcinoma
，
为关键词进行检索
，
并
于肾嫌色细胞癌的
组数据
，下载的
公开的关
组数
•
式为
FPKM
。
通过
的
组数据获取临床样本
共
89
例
，
其中肾
胞癌样本
65
例
，
正常组织
24
例
。
1
.
2
法
1.2.1
获取差异基因
应用
R
软件中的
edgeR
算
法对肾
胞癌的数据集进行标准化处理和差异表
红点
：
基于
logFC
>
2.
5
且
P
V
0.05
筛选的下调基因
；绿
点
：
基于
logFC
<
—
2.
5
且
P
<
0
05
筛选的下调基因
；黑
点
：
没有显著差异的基因
；
FOR
：
差异倍数
。
达分析
，
根据差异倍数
(log2)
绝对值
>
2.
5
和
FDR
调
整后
P
<
0.
05
作为标准
，
发现差异表达基因
1
850
个
，
其中表达上调基因
760
个
，
表达下调基因
1
090
个
。
并利用
ggplot2
软件包对数据进行图形可视化
。
1.2.2
差异表达基因
的
GO
富集分析
和
KEGG
富
集分析
通过
DAVID
数据库
(DAVID
；
https
：
//
da-
图
1
两组样本之间数据的差异表达基因
2.2
差异表达基因的
GO
富集分析和
KEGG
通路
富集分析结果
通过
GO
富集分析和
KEGG
通路富
集分析筛选的差异表达
的生物学功能
，
在
GO
富
集分析中包括生物学过程
(
biological
process,
BP)
、
vid.
ncifcrf.
gov)
对筛选的显著差异基因进行
GO
富
集分析和
KEGG
通路富集分析
，
&
<
0.
05
为统计学
具有显著差异
，
应用
R
软件及相应的
clusterProfiler
进行注释及可视化
。
细胞组成
(cell
composition,
CC)
和分子功能
(molec
1
.
2
.
3
Hub
基因
的
筛
选
STRING
数据库
(h--
ular
function,MF)
，
在
BP
中差异基因主要富集于跨
膜转运
、
化学
tps
：
//string-db.
org/)
用于识别己知和预测蛋白与
的相互作用
「
I
。
使用
STRING
对差异表
、
膜电位调和消
，
在
CC
中差
要富集于质膜的组成部分
、
质膜
、
达基因进行分析并构建蛋白互作
(protein
protein
in
顶质膜和细胞外区域
，
在
MF
中差
要富集于
teraction
,
PPI
)
网络
，
采用
Cytoscape
软件中的
Cyto
-
激
性
、
氧化还原酶活性和钙离子结合
，
在
KEGG
通路分析中主要富集于神经活性配体-受体相
互
作
hubba
插件从
STRING
构建的
PPI
网络中筛选获取
前
10
位
Hub
基因
。
1.2.4
对关键基因进行生存分析
利用
R
软件对
用
、
视黄醇代谢
、类固醇激素的合成
。
主要富集结果
见表
1
、
表
2
和图
3
。
http
：
/
/jmurology.
xjtu.
edu.
cn
；
zgmnwk.
cug.
top
64
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J
Mod
Urol,
Vol.
26
No.
1
Jan.
2021
。
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^
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7
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1
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S
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9
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C
百
I
H
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Did
IV8HCHV
Hewsov
IVLLDD
eHoVG
VSdVN
saHGO
I
V
/
V
I
D
Nano
ooxd
EROV
zdov
TCGA-KN-8429-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8430-11A-01R-23
15-07
TCGA-KO-8403-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8425-11A-01R-2315-07
TCGA-KL-8326-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8428-11A-01R-2315-07
TCGA-KL-8329-11A-01R-2315-07
TCGA-KL-8339-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8433-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8434-11A-01R-23
15-07
TCGA-KL-8324-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8435-11A-01R-23
15-07
TCGA-KL-8336-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8431-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8419-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8424-11A-01R-23
15-07
TCGA-KO-8415-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8422-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8437-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8427-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8436-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8426-11A-01R-23
15-07
TCGA-KN-8423-11A-01R-2315-07
TCGA-KN-8432-11A-01R-2315-07
TCGA-KO-8417-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8333-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8421-01A-11R-2315-07
TCGA-KM-8440-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KO-8413-01A-11R-2315-07
TCGA-KM-8443-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KO-8410-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8414-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8423-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8418-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8425-01A-11R-23
15-07
TCGA-KM-8442-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KN-8429-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8330-01A-11R-23
15-07
TCGA-KM-8639-01A-11R-2403-07
TCGA-KL-8325-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8343-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8340-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8404-01A-11R-2315-07
TCGA-KO-8409-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8326-01A-11R-23
15-07
TCGA-KM-8477-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KN-8419-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8338-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8334-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8434-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8327-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8405-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8332-01A-11R-2315-07
TCGA-KO-8408-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8426-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8406-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8324-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8433-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8416-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8342-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8403-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8346-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8344-01A-11R-23
15-07
|TCGA-KL-8323-01A-21R-2315-07
TCGA-KN-8428-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8329-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8341-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8336-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8437-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8427-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8335-01A-11R-23
15-07
TCGA-KM-8439-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KL-8337-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8331-01A-11R-2315-07
TCGA-KO-8411-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8345-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8435-01A-11R-23
15-07
TCGA-KL-8339-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8432-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8430-01A-11R-23
15-07
TCGA-KO-8407-01A-11R-2315-07
TCGA-KM-8441-01A-11R-23
15-07
TCGA-KM-8438-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KN-8431-01A-11R-2315-07
TCGA-KL-8328-01A-11R-2315-07
TCGA-KM-8476-01
A-l
1R-23
15-07
TCGA-KO-8415-01A-11R-23
15-07
TCGA-KN-8436-01A-11R-2315-07
TCGA-KN-8424-01A-11R-2315-07
图
2
肾嫌色细胞癌及癌旁正常组织差异表达最显著的前
50
个基因热图
http
:/
/jmurology
.
xjtu.
edu.
cn
；
zgmnwk.
cug.
top
现代泌尿外科杂志
2021
年
1
月第
26
卷第
1
期
65
表
1
肾嫌色细胞癌差异表达基因
GO
富集分析结果
分类
目录
功能
跨膜转运
计数
P
值
BP
BP
BP
BP
BP
BP
BP
BP
BP
BP
GO
:
0055085
GO
:
0006814
GO
:
0001523
GO
:
0007588
GO
:
0007601
GO
:
0007268
GO
:
0006810
GO
:
0042391
GO
:
0007586
GO
:
0006811
GO
:
0005615
GO
:
0005576
GO
:
0005887
GO
:
0016324
GO
:
0005578
GO
:
0005886
GO
:
0031526
GO
:
0016021
GO
:
0070062
GO
:
0045202
GO
:
0030054
GO
:
0031225
GO
:
0008201
GO
:
0005179
GO
:
0005509
GO
:
0004497
GO
:
0019841
GO
:
0016705
GO
:
0005249
57
26
21
16
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
钠离子转运
类维生素
A
代谢过程
排泄
视觉感知
42
47
61
化学突触传递
运输
膜电位的调节
22
19
消化
离子
细胞外空间
29
CC
CC
CC
CC
CC
CC
CC
CC
CC
CC
CC
CC
241
272
细胞外区域
质膜的组成部分
241
74
顶质膜
胞外
膜
64
493
23
刷边膜
膜的组
部分
580
333
39
胞外泌体
突触
细胞连接
74
26
39
膜的
固
分
肝素结合
MF
MF
MF
MF
MF
MF
MF
激性
离子结合
27
106
19
单加氧酶活性
视
醇结合
9
氧化还原酶活性
，
作用于成对的供体上,并结合或还原分子氧
电压门控钾通道活性
18
18
表
2
肾嫌色细胞癌差异表达基因
KEGG
通路富集分析结果
分类
录
功能
神经活性配体-受体相
互
作用
计数
P
值
KEGG
KEGG
KEGG
KEGG
KEGG
hsa04080
hsa00830
hsa00980
hsa00982
hsa00140
63
22
0.000
0.000
0.000
0.002
视黄醇代谢
细胞色素
P450
代谢异种生物
药物代谢-细胞色素
P450
类固醇激素的合成
23
21
18
0.015
http
:
!
/jmurology.
xjtu.
edu.
cn
；
zgmnwk.
cug.
top
66
J
Mod
Urol,
Vol.
26
No.
1
Jan.
2021
-logl0(P<)
棊细胞色素
P450
代谢异种生物-
•
视黄醇代谢-
•
Percent
・
1.0
•
1.5
•
2.0
•
2.5
•
3.0
类固醇激素的合成"
20
30
40
50
60
Count
A
：
差异基因
GO
富集可视化
；
B
：
差异基因
KEGG
通路富集可视化
。
图
3
差异基因富集分析可视化
2.3
差异表达基因的
PPI
网络分析结果
通过
对
肾
STRING
数
胞
瘤发病的
差异表
达
前
10
位
Hub
KNG1
AGT
构建
PPI
网络
，
利用
Cytoscape
软件中
Cytohubba
筛
选
PPI
网络中的连接
(图
4
),
GASR
分别是:
KNG1
*
AGT
、
CASR
、
SST
、
AGTR2
、
PMCH
、
AGTR2
SST
GNG4
、
DRD2
、
MCHR2
、
SSTR3
。
2.4
关键基因的生
存
分析
对排名前
10
位的
Hub
基因进行生存分析
，
构建出
Kaplan-Meier
生存曲
线
，
发现
MCHR2
的表达对肾嫌色细胞癌
P
DRD2
PMCH
GNG4
的总生存率
(overall
survival,OS)
影响差异有统计学
意义
(
P
V
0.05),
其余基因的表达水平都与肾嫌色细
MCHR2
SSTR3
胞癌无显著相关性
。
1.0
0.8
圧
0.6
州
0.4
0.2
0
KNG1
生存曲线
(P=0.485
14)
AGT
生存曲线
(P=0.867
3)
图
4
PPI
网络筛选的
10
Hub
基因
1.0
1.0|
1.0
'
—
—
黑
0.8
>°-
8
屈
0.6
肚
0.6
划
0.4
-
|-High|
划
0.4
胡
0
-High-High-High
-High
—
Low
.
Low
|
—
Low
-
Low
-
Low
0.2^
0
』
0.2
0.2
0
0
l~
........................
—
°
0
2
4
6
8
10
12
o
L
.............................
0
2
4
6
8
10
12
0
2
4
6
8
10
12
0
2
4
6
8
10
12
0
2
4
6
8
10
12
时间(年)④
GASR
生存曲线
(P=0.946
87)
SST
生存曲线
(P=0.094
44)
1.0|
j
AGTR2
生存曲线
(P=0.091
81)
时间(年)
®
时间(年)
©
时间(年)@时间(年)@
0
#
.8
>
.6
4
O.
划
O.
O.
.2
1.0
「
飞
PMCH
生存曲线
(P=0.699
02)
1.0
GNG4
生存曲线
(P=0.415
32)
DRD2
生存曲线
(P=0.832
41)
1.0
1.0
»
0,8
MCHR2
生存曲线
(P=0.042
77)
o
o
O
SSTR3
生存曲线
(P=0.579
23)
L»
0
-
8
母
).4
0.2
-High
—
Low
—
班
).4
0.2
02
46
8
10
12
时间(年)
①
0
!■
..................................
o
l~
.............................
0
2
4
6
8
10
12
0
2
4
6
8
10
12
0
!■
.............................
0
l~
..........................
,
02
46
8
10
12
o
L
.............................
0
2
4
6
8
10
12
时间(年)①
时间(年)
®
时间(年)
@
时间(年)
®
A
：
KNG1
；
B
：
AGT
；
C
：
CASR
；
D
：
SST
；
E
：
AGTR2
；
F
：
PMCH
；
G
：
GNG4
；
H
：
DRD2
；
I
：
MCHR2
；
J
：
SSTR3
。
图
5
10
个关键基因的
KaplairMeier
生存曲线
http
:
/
/jmurology
.
xjtu.
edu.
cn
；
zgmnwk.
cug.
top
现代泌尿外科杂志
2021
年
1
月第
26
卷第
1
期
67
3
肾嫌色细胞癌是起源于肾小管集合上皮细胞的
过
表达可能
RCC
癌
胞的
能
及癌
胞的钙依赖性粘附
，
从而增加骨转移的概率
(
16
)
。
此
外
，
DRD2
缺失也与多种肿瘤的发生有关
(17)
,
大量研
究显示
DRD2
与结直肠癌
、
非小细胞癌和胃癌的发
病皆有关联
。
这是因为
DRD2
具有遗传多态性
，
这
种多态性与细胞
mRNA
的稳定性和蛋白质翻译的改
恶性肿瘤
，
虽然临床上不常见,但是在
nccRCC
中
，
其
发病率仅次于乳头状腺癌归
。
虽然
chRCC
少见且为
低度恶性潜能的肿瘤
，
但是仍有部分预后差
、
进展期
的患者需要辅助治疗。
因此将
chRCC
各个时期与环
节中共同表达的相关基因进行深入研究
，
挖掘出疾病
变有关
，
DRD2
密度的降低会减少对细胞生长的
抑制及改变细胞内凋亡信号
，
从而导致细胞的癌变
，
发生与发展中起关键调控作用的基因
，
对了解疾病的
增加患癌症的风险
。
MCHR2
是黑色素浓缩激素
(
Modifierofchinchi
l
a
，
MCH
)
的
体
一
，
机制
、
改进疾病的治疗措施以及相应
靶
向药物的研发
十分重要
。
位于人类第
6
号染色体长臂上
(19)
。
本研究发现
本研究致力于筛选并分析与肾嫌色细胞癌发病
及进展相关的关键基因
，
通过对
TCGA
数据库检索
MCHR2
是唯一与肾嫌色细胞癌患者的
OS
有显著
相关性的关键基因
。
研究发现
MCHR2
和
肥胖
症密
切相关
,MCHR2
受到
MCH
的激活后调节下丘脑的
筛
共
出
肾
胞癌差
表达
1850
，
其中包括了表达上调基因
760
个和表达下调基因
能量稳态调节器,从而控制机体的饮食行为和能量消
耗
(
0
)
,
特别是非典型抑郁症患者
MCHR2
基因的变
1
090
个
。
通过
GO
富集分析和
KEGG
富集分析来
筛选与分析差异表达基因
，
最终得到各个差异表达基
异是其
BMI
升高的危险因素之一
(1)
。
在肿瘤中尚
因的生物学功能
。
在
BP
中差异基因主要富集于细
胞跨膜转运
、
化学突触传递
、
膜电位调节等
。
在
CC
中差异基因富集于细胞外区域
、
质膜
。在
MF
中差异
无
MCHR2
基因的研究
，
本研究显示
MCHR2
与肾
胞癌
后
著相关
，
MCHR2
可作
肾
嫌色细胞癌研究的新方向
。
本研究从
TCGA
数据库中筛选出了与
chRCC
基因主要富集于氧化还原酶活性
、
钙离子结合
、
K
离
子通道等
。
在
KEGG
通路分析中主要富集于神经活
性配体-受体相互作用
、
视黄醇代谢
、
类固醇激素的合
疾病发生与发展相关的基因
，
并挖掘及讨论与肾嫌色
细胞癌相关的关键基因
。
MCHR2
有可能成为肾嫌
色细胞癌潜在的治疗
靶
点及预后标志物
。
但是
，
由于
与肾嫌色细胞癌相关的基因层面的研究仍缺乏
，
因此
成
。
随后进一步通过
STRING
数据库对肾嫌色细胞
癌差异表达基因构建
PPI
网络
，
结果发现这些基因编
码的蛋白调节点主要集中在
KNG1
、
AGT
、
CASR
、
还需要大量的研究来阐明这些基因在肾嫌色细胞癌
的发病机制中的生物学功能
，
并为肾嫌色细胞癌的治
疗提供新的线索和方向
。
参考文献
：
(
1
)
BARATA
PC,RINI
BI.
Treatment
of
renal
cell
carcinoma
：
Cur-
rentstatusandfuturedire0tions
(
J
)
.CA
Can0erJClin
，
2017
，
67
(
6
)
：
507-524.
SST
、
AGTR2
、
PMCH
、
GNG4
、
DRD2
、
MCHR2
、
SSTR3
。
激肽原
(Kininogen
1,KNG1)
重组蛋白参与机体
各种生理活动
，
例如控制血管的扩弓
、
维持水电解质
的平衡以及调控细胞的凋亡等如今越来越多的
证据表明
KNG1
似乎具有抗血管生成的功能
，
并能
阻断内皮细胞的增殖
，在癌症的发生起到一定的作用
(10)
。
此外还有研究表明
，
在癌症患者的血清中检测
(
2
)
YIN
X
，
WANG
J
，
ZHANG
fi0ation
ofbiomarkers
of
0hromophoberenal0e
l
0ar0inomaby
weightedgene0o-expression
到
KNG1
基因的低表达
，
因此
KNG1
可以作为癌症
和晚期大肠腺瘤的潜在血清预测因子
(11)
。
编码血管
networkanalysis
(
J
)
.Can0erCe
l
Int
，
2018
，
26
(
18
)
：
206-219.
紧张素原的
AGT
则可以抑制肿瘤的进展和转移
，
因
为有研究已证实
AGT
能够独立于血管紧张素
*
在
()
PRASAD
SR,
HUMPHREY
PA,
CATENA
JR,et
al.
Common
anduncommonhistologicsubtypesofrenalce
l
carcinoma
：
Ima-
ging
spectrum
wth
pathologic
correlation
(J
).
Radiographics
,
机体内产生非常强大的抗血管生成作用™
，
实验中
2006
，
26
(
6
)
：
1795-1806,
AGT
的过度表达能明显降低肿瘤内新生血管的形
成
，
从而延缓了肿瘤的发展
［
13
］
，
这代表了
AGT
有望
成为抑制肿瘤生长和转移的新的研究方向
。
CASR
基因在人体肾脏组织中广泛表达
，对维持人体健康组
LEE
WK,BYUN
SS,KIM
HH,et
al.
Characteristics
and
progno
sis
of
chromophobe
non-metastatic
renal
cell
carcinoma
:
A
multi
center
study
().
Int
J
Urol
,2010,17
(
11
)
：
898-904.
()
周耀军
，
何小舟
，
夏炜
，
等•肾嫌色细胞癌
28
例临床分析并文献
复习
()•
中国肿瘤外科杂志
2019,11(6
)
：
450-452.
织的钙稳态起着至关重要的作用
［
14
］
„
最近一项研究
()
SZKLARCZYK
D,
GABLE
AL,
LYON
D,et
al.
STRING
v11
：
Protein-protein
association
networks
withincreased
coverage
%
证明
，
在肾部分切除术后
5
年内发生骨转移的细胞标
本中
，
CASR
的表达最高
(15)
。
研究也指出
CASR
的
supporting
functional
discovery
in
genome-wide
experimental
datasetsEJ
］
.
Nucleic
Acids
Res,2019,47
(DI
)
：
607-613.
http
：
//jmurology.
xjtu.
edu.
cn
；
zgmnwk.
cug.
top
68
ALHUNAIDI
O,
AHMAD
AA,EL-NAHAS
AR,et
al
Impact
of
J
Mod
Urol,
Vol.
26
No.
1
Jan.
2021
[
15
]
JOECKEL
E,
HABER
T,PRAWITT
Det
al.
High
calcium
con-
0entrationinbonespromotesbone
metastasisinrenal0e
l
0ar0i-
nomas
expressing
0al0ium-sensing
re0eptor
[
J
]
.Mol
Can0er
%
case
volume
per
year
on
flexible
ureteroscopy
practice
:
An
inter
net
based
surveyBMC
Urol,2019,
1
9
(
1)
:
134-135.
CHEVILLE
JC,
LOHSE
CM,SUKOV
WR,et
al.
Chromophobe
renal
cell
carcinoma
:
The
impact
of
tumor
grade
on
outcome[J
)
.
Am
J
Surg
Pathol,
2012,36(6)
：
851-856.
2014
26
(
10
):
1342-1355.
[
16
]
ZEKRIJ
%
AHMED
N
%
COLEMAN
RE
letalmeta-
stati00ompli0ationsofrenal0e
l
0ar0inoma
[
J
]
.IntJOn0ol2001
%
郭红霞
，
胡金艳
，
胡水旺
，
等•妊娠期高血压疾病孕妇尿液中激肽
原
1
含量的变化中国妇幼保健
,2015,30
(15
):23392341.
19
(
2
):
379-382.
[
17
]
GEMIGNANIF
%
LANDIS
%
MORENO
V
%
rphisms
ofthedopaminere0eptorgene
DRD2and0olore0tal0an0errisk
[J
]
.Can0erEpidemiolBiomarkersPrev
2005
14
(
7
):
1633-1638.
[1
0
]
KAWASAKI
M,
MAEDA
T,
HANASAWA
K,et
al.
Effect
of
His-Gly-Lys
motif
derived
from
domain
5
of
high
molecular
weightkininogen
on
suppression
ofcancer
metastasis
bothin
vitro
and
in
vivo[J].
J
Biol
Chem,2003
,278(49
)
:
49301-49307.
[18
]
DUAN
J,
WAINWRIGHT
MS,COMERON
JM,et
al.
Synony-
mousmutationsinthehumandopaminereceptorD2
(
DRD2
)
af-
[
11
]
WANG
J,
WANG
X,LIN
S,et
al.
Identification
of
kininogen-1
as
Aserum
biomArker
for
the
eArly
detection
ofAdvAnced
colorectAl
adenoma
and
colorectal
cancer
().
PLoS
One2013
,8(7)
:
70519
-
fectmRNAstabilityandsynthesisofthereceptor
[
J
]
,Hum
Mol
Genet2003
12
(
3
):
205-216,
[
19
]
SAILER
AW
%SANO
H
%
ZENGZ
etalIdentificationandcharac-
terizationofasecond
melanin-concentrating
hormonereceptor
%
70532.
[
12
]
BOUQUET
C,LAMANDE
N,
BRAND
M,et
al.
Suppression
of
angiogenesis,tumor
growth,and
metastasis
by
adenovirus-media
MCH-2R
[
J
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,Proc
Natl
Acad
Sci
USA
%
2001
%
98
(
13
):
7564-
7569,
ted
gene
transfer
of
human
angiotensinogen
Q]
.
Mol
Ther,2006
,
14
(
2
):
175-182.
[
0
]
KISHI
T
,
ELMQUIST
JK.
Body
weight
is
regulated
by
the
brain
:
Alinkbe"weenfeedingandemo"ion
[
J
]
.MolPsychia"ry
%
[
13
]
VINCENT
F,BONNIN
P,CLEMESSY
M,et
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Angiotensino-
gendelaysangiogenesisandtumorgrowthofhepatocarcinomain
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[I]
GHOUSSAINI
M,VATIN
V,LECOEUR
C,et
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Genetic
study
ofthe
melanin-concentrating
hormonereceptor2in
childhood
transgenic
mice
(].
Cancer
Res
,2009,69(7
)
:
2853-2860.
[
14
]
DIEZ-FRAILE
A,LAMMENS
T,
BENOIT
Y,et
al.
The
calci-
um-sensingre0eptorasaregulatorof0e
l
ularfateinnormaland
pathological
conditions
Q]
.
Curr
Mol
Med,
2013,13(2
)
:
282295.
andadulthoodsevereobesity
[
J
]
.JClinEndocrinolMetab
2007
%
92
(
11
):
4403-4409.
(编辑何宏灵
)
(上接第
35
页
)
乃至免疫治疗可使患者获益
，
根治性切除术应作为这
[
8
]
WILSONS
JUSTIN
M
IFEANYI
O
porarytreat-
mentpa
ternsandoutcomesofsarcomatoidbladdercancer
[
J
]
.
WorldJUrol2016
35
(
7
):
1055-1061.
[
9
]
VIEIRA
T
%
GIRARD
N
%
UNG
M
et
al.E
f
icacy
offirst-line
chemotherapyinpatientswithadvancedlungsarcomatoidcarci-
类病
理
的首选
，
加强对
肉
瘤样癌患者的术后随访
、
记
录及宣教
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