基于gyrB靶标PCR扩增检测土壤中典型病原菌

基于gyrB靶标PCR扩增检测土壤中典型病原菌

2023年7月27日发(作者:)

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基于gyrB靶标PCR扩增检测土壤中典型病原菌

作者:刘燕 吴晴晴 刘娟娟

来源:《中国科技博览》2016年第24期

[摘 ;要]探索基于gyrB靶基因的PCR扩增技术,检测土壤中典型病原菌的最优反应条件和参数。实验目的是建立gyrB基因PCR扩增检测土壤中典型病原菌的最佳反应条件:退火温度、镁离子浓度、引物浓度等。

[关键词]gyrB基因 ;典型病原菌

中图分类号:TH113.22 文献标识码:A 文章编号:1009-914X(2016)24-0124-01

引言

研究[1]表明在区别相似种时,gyrB 序列可以比16S rDNA 序列更有优势。在定量分析研究上基于gyrB靶基因的研究方法比基于16S rDNA的方法更适用。本研究建立gyrB基因PCR扩增检测土壤中典型病原菌的最佳反应条件和参数,证明gyrB 基因在土壤中典型病原菌株鉴定上的优势。

1 材料与方法

1.1 土壤样品的采集及预处理

研磨过筛(20目),-80°C保存备用。

1.2 供试病原菌株

鼠伤寒沙门氏菌、副伤寒沙门氏菌、福氏志贺菌、大肠杆菌、肠炎沙门氏菌、铜绿假单胞菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌等。

1.3 主要试剂盒及试剂

FastDNA? SPIN Kit for Soil 试剂盒(MP Biomedicals, Solon, OH, USA),dNTP、Taq DNA聚合酶、引物、100 bp DNA Ladder(上海生物工程技术服务有限公司。

1.4 主要仪器

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