Vazyme 产品特点概述与常见问题解决方案(纵)

Vazyme 产品特点概述与常见问题解决方案(纵)

2023年7月29日发(作者:)

PCR

Taq, Taq Plus,LAmp

【简述】这三个产品都属于Taq类别的产品,后两种是在Taq基础上开发出来的改良版的Taq酶,都属于低保真度类型的检测鉴定用酶。

【特点】

Taq,最常用的分子生物学试剂,扩增长度一般都为2kb以内。适用于一些基本的检测鉴定试验,非常常用,市场极大。

Taq Plus,改良版的Taq酶,提高了扩增效率和扩增能力,扩增产量高于Taq,对基因组或者cDNA等复杂模板适应度高于Taq。扩增长度为简单模板(质粒等)20kb以内,复杂模板(基因组或者cDNA)10kb以内。

LAmp,改良版的Taq酶,提高了Taq酶对长片段的扩增能力。性能和Taq Plus类似。(可以和Taq Plus替换使用)

【改良原理】

Taq酶虽然扩增能力很强,但是因其无校对活性,所以扩增错配较多,尤其是对于长片段扩增而言,错配碱基将导致Taq酶与模板的解离,因此其扩增长度往往只能到2kb。为了克服这一缺点,Vazyme将Taq酶改造,使其拥有了适度的校对活性,有效解决了这一问题。

【常见问题】

1. 扩增模板(纯度完整度)

2. 扩增引物(是否降解,是否成功使用过)

3. 扩增程序(标准程序参见说明书)

4. TA克隆的问题:如果用户扩增后续实验要做TA克隆,推荐用户使用Taq,因后两种酶做TA克隆的效率要低于Taq酶。

【产品优势】

技术壁垒相对简单,因此主要优势在于价格和稳定性。

AceTaqTM

【简述】这个产品也属于Taq类别的产品,是在Taq基础上开发出来的改良版的Taq酶,都属于低保真度类型的检测鉴定用酶。

【特点】

AceTaq,热启动版本的(Hot-Start)Taq酶。常温下以及预变性之前的升温阶段完全没有聚合酶活性。只有在95℃加热5分钟之后才能释放酶活转变为Taq酶。该产品较Taq而言,具有更高的扩增特异性。因此扩增条带更单一,扩增所需要的模板量更低(个位数拷贝的基因组也可正常扩增)。但是少数情况下,该酶的扩增效率略低(相对于Taq而言)属正常情况。扩增长度和taq酶一样,一般要求小于2kb。

【改良原理】

非特异性扩增对于Taq酶扩增而言,有两个负面效应:一是非特性扩增的存在会干扰后续实验;二是非特异性扩增的存在会减弱目标扩增的效率,导致目标扩增产无量降低甚至消失。简而言之,非特异性扩增时PCR反应的毒药。

PCR过程中非特异性扩增主要产生于反应体系配制和预变性升温阶段,只要让这一过程中Taq酶没有聚合酶活性就可以有效抑制非特异性扩增。Vazyme使用化学修饰的方法修饰了Taq酶,得到的AceTaq在常温下和预变性升温阶段完全没有酶活。和其他公司采用的单克隆抗体封闭酶活相比,化学修饰法对酶活的封闭更完全,热启动更严谨,因此扩增更特异。

【常见问题】

1. 扩增模板(纯度完整度)

2. 扩增引物(是否降解,是否成功使用过)

3. 扩增程序(标准程序参见说明书,预变性必须超过5分钟,用于充分释放酶活)

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【产品优势】

特异性更高,检测下限更低(正常扩增需要的最低模板量)

PhantaTM

【简述】基于pfu的第三代超保真聚合酶,保真度是普通taq酶的50多倍。用于需要保真度的PCR扩增。

【特点】

1.快:极限速度1秒钟2.5kb。推荐用户15秒/kb

2.长:保真度越高的酶扩增能力越差,phanta克服了这一点。简单模板30kb,复杂模板10kb,广泛适用。

3. 保真度高:Taq酶的50多呗,Pfu的6倍

4. 扩增能力强:对模板的解读能力强,扩增产量高,广泛适用于各种类型模板。

【改良原理】

保真度越高的酶扩增能力越差,因此一般高保真酶对于长片段、复杂模板都无法有效扩增。Vazyme对pfu做了系统的蛋白工程改造,显著提高了pfu对模板的亲和力和行进性。此外,Vazyme对Phanta的反应缓冲体系进行了反复优化,并添加了扩增增强子,有效的去除了高保真酶容易dUTP中毒的问题。因此,phanta聚合酶无论对于短片段还是长片段,简单模板还是复杂模板都具有优异的扩增能力。

【常见问题】

1. 扩增模板(纯度完整度)

2. 扩增引物(是否降解,是否成功使用过)

3. 扩增程序(延伸时间不能超过30秒/kb)

【产品优势】

保真度高、扩增速度快、长片段扩增能力强、扩增产量高、扩增特异性强、模板适应性广

PCR Enhancer

【简述】PCR扩增增强剂混合液,任何PCR用酶都适用

【特点】

1. 提高GC-Rich片段扩增能力

2. 提高具有高级结构的片段的扩增能力

3. 有时候可以让不能扩的便能扩,能扩的变得扩的更好;当然也有让能扩的变得不能扩的时候。建议用户在无法正常扩增时尝试。

【改良原理】

多种PCR增强剂混合物

【常见问题】

有时候可以让不能扩的便能扩,能扩的变得扩的更好;当然也有让能扩的变得不能扩的时候。建议用户在无法正常扩增时尝试。

使用后聚合酶的保真度可能会降低!建议用户酌情使用

【产品优势】

一个非常神奇的溶液,兼容所有的PCR用酶

RT-PCR

RNA Keeper Tissue Stabilizer

【简述】细胞、组织日后用于RNA提取,推荐用户将其保存在该溶液中

【特点】细胞、组织高稳定性保存液,可以有效抑制存贮过程中RNA的降解。

【改良原理】

RNA是逆转录(RT)反应的模板,因此其质量直接决定逆转录是否成功。因为RNA酶非常强悍,因此RNA极易被降解,这将导致逆转录无法完成。为了保证RNA的完成性,新鲜细胞、组织离体后因迅速提-2-

取。如果无法立即提取,因将细胞组织用合适的方法保存,避免RNA的降解。该产品为多种RNA抑制剂的混合物,可高效抑制RNAase酶活性,进而提高细胞、组织保存成功率。新鲜组织在该溶液中可以实现:37 ℃保存1天,25 ℃保存1周,4 ℃保存4周,-20 ℃/-80 ℃长期保存后RNA无降解。

【常见问题】

保存效果不佳

推荐用户将组织块剪碎之后再泡在该产品里。

【产品优势】

和进口的相比便宜{RNAlater,Ambion},而且性能非常稳定

RNA isolater Total RNA Extraction Reagent

【简述】总RNA提取试剂,也叫TRIZOL

【特点】系统成熟,重复性好,成本低

【改良原理】无改良

【常见问题】

1. 样品保存:新鲜的组织或细胞如果不是立刻提取需液氮速冻后-80度保存

2. 提取问题:A:组织、细胞样品不宜太多

B: 基因组污染:氯仿抽提步骤低温离心;上清吸取不宜太完全

C:组织样品破碎方式:最好为匀浆或者液氮研磨

【产品优势】

和进口的相比便宜,而且性能非常稳定

Murine Rnase inhibitor

【简述】逆转录反应可能会用到的RNA酶抑制剂

【特点】

高抗氧化能力(非常稳定),重组表达(纯度非常高),无需高浓度DTT存在(与RT-PCR/qPCR反应体系高度兼容)

【改良原理】

1. 更换人来源的为鼠来源的

2. 可溶性重组表达

【常见问题】

暂无

【产品优势】

和进口的相比便宜,而且性能非常稳定

HiScript Reverse TranscriptaseTM

【简述】在MLV(H-)基础上改造而成的高效逆转录用酶

【特点】

1. 热稳定性高,最高可耐受55℃的反应温度(有效消除RNA二级结构对逆转录反应的影响)

2. 高效逆转录,和同类产品相比在50℃拥有最高的cDNA产量

3. 增强了与RNA模板的亲和力,一方面可获得更多全长的cDNA产物;令一方面提高了逆转录灵敏度,可以检测低至1pg的总RNA

4. 具有更高的逆转录保真度,减少了逆转录过程中错配的可能性

【改良原理】

逆转录过程中最常见的问题就是RNA二级结构了。如果逆转录在较低的温度下进行,RNA的二级结构往往会导致逆转录反应的提前终止;如果逆转录反应在高温下进行,常规的逆转录酶又极容易失活。因此,Vazyme对MLV进行了系统的工程学修改。首先提高了其耐高温能力,这样逆转录反应就可以在更高的温-3-

度下进行,显著减弱了RNA高级结构对逆转录反应的影响。其次,我们提高了MLV对模板的亲和力,使得等多的全长cDNA可以被成功合成,因此HiScript具有非常高的灵敏度,可以有效检测低至1pg的总RNA,使得少量模板以及低拷贝基因的逆转录也能正常完成。最后,我们在MLV的基础上进一步提高了其逆转录保真度,减少了逆转录过程中错配的可能性。

【常见问题】

1. RNA模板(纯度完整度)

2. 逆转录引物(是否降解,是否成功使用过)

3. 逆转录程序(参见说明书要求)

4. cDNA扩增体系是否正常工作

【产品优势】

高温逆转录、检测灵敏度、逆转录保真度高

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit ( For qPCR)

【简述】包含HiScript的第一链cDNA合成试剂盒

【特点】1. 酶的特点同HiScript

2. 试剂盒特点:

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit:反应所需要的酶合并为Enzyme Mix,所需要的缓冲液及dNTP合并为2 X Reaction Mix,只需要加入模板和引物(用户自备,Oligo dT,随机引物或者基因特异性引物均可)即可开始反应。使用便捷。

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit( For qPCR):反应所需要的酶合并为qRT Enzyme Mix,所需要的缓冲液、dNTP、引物合并为2 X qRT Mix,只需要加入模板即可开始反应。其中2 X qRT Mix中的引物为Oligo dT引物和随机引物的混合物,使逆转录cDNA更适合后续qPCR反应。

【改良原理】

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit:合并组分,简化操作。反复测试提高稳定性。

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit( For qPCR):

1. 合并组分,简化操作。反复测试提高稳定性。

2. Oligo dT或者随机引物单独进行逆转录时,RNA链的不同位置逆转录效率很不均匀,不利于qPCR对基因量的准确测定。该试剂盒提供了混合引物做为逆转录引物(经过反复优化),消除了逆转录的不均匀性。

【常见问题】

同HiScript常见问题

【产品优势】(基本优势和HiScript一样,此外试剂盒还有如下优势)

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit, 使用便捷

HiScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit ( For qPCR),使用便捷,更适合qPCR

qPCR

AceQ qPCR Master Mix

【简述】使用AceTaq配制的荧光定量专用MIX,分为染料法和探针法两版本

【特点】1. 酶的特点同Ace Taq

2. Mix特点:

染料法:反复调整的优化体系。具有超强的适应性。扩增高度特异,非特异性扩增和引物二聚体较同类产品优势巨大。线性范围广、实验重复性好、检测灵敏度高,对GC-rich和有高级结构的片段有良好的兼容性。

探针法:反复调整的优化体系。具有超强的适应性。扩增高度特异,非特异性扩增和引物二聚体较同类产品优势巨大。线性范围广、实验重复性好、检测灵敏度高,对GC-rich和有高级结构的片段有良好的兼容性。

【改良原理】

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酶方面的改良:参见AceTaq(热启动增强扩增特异性和检测灵敏度)

Mix的改良:Mix版本具有高度的稳定性,长期存放没有问题。反应缓冲体系针对染料法和探针法都做了反复测试优化,兼容性好,性能超群。

【常见问题】

1. 扩增模板(纯度完整度)

2. 扩增引物探针(是否降解,是否成功使用过)

3. 扩增程序

4. 仪器设置是否正确(软件较复杂,容易出错)

【产品优势】

酶方面的优势:参见AceTaq,主要是严格热启动和扩增高度特异

Mix方面的优势:贮存稳定,反应体系经过反复优化,有效提高了兼容性和扩增特异性(添加有独特配方的扩增增强因子)

克隆相关

pEM-T/pUM19-T/ pUM19- Simple T

【简述】TA克隆专用载体,都可以进行蓝白斑筛选

【特点】1.克隆成功率高

2. 自连背景低

3. pEM-T和pUM19-T两种不同的载体骨架,多克隆位点的酶切位点不同;pUM19- Simple T在pUM19-T的基础上删除了多克隆位点。用户可根据需要自行选择。

【改良原理】

常规的T载体是使用平端的线性化载体末端加T制成。这种方式加T的效率很低,因此最终载体中有很多末端都没有T。一方面,这会导致连接成功降低;另一方面也会使载体自连背景升高。Vazyme修改了T载体的生产工艺,使用一种更先进的方法生产T载体,最终Vazyme的T载体中超过99%的DNA片段末端都带有碱基T。因此有效解决了成功率低和自连率高的问题。

【常见问题】

1. 克隆片段越长,成功率越低(大于3kb的片段应鉴定24个以上的单克隆)

2. 高保真酶PCR扩增产物,应先加A再克隆。(但是加A效率很低,所以克隆成功率会下降,自连率会上升。Phanta PCR产物不能直接加A,应先将扩增产物纯化后再加A)

3. 感受态效率低(应超过106cfu/ug)

【产品优势】

自连率低

成功率高

便宜

T4 DNA ligase

【简述】DNA连接酶

【特点】高纯度,高活性

【改良原理】

重组表达。先进的纯化工艺,酶的纯度极高;无核酸酶污染。

【常见问题】

暂无

【产品优势】

纯度高、活性高

ClonExpress

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【简述】重组克隆系统

【特点】1.片段无需酶切消化,操作简单,不受酶切位点选择限制

2. 克隆效率高,自连背景低(体系中无连接酶,单切载体无需脱磷酸)

3. 无缝克隆首选

4. 可进行多片段无缝克隆、点突变等高级实验

【改良原理】

用先进的同源重组方式代替传统的酶切连接方式进行载体构建。因此,克隆构建不再受酶切位点选择限制。可以向任意载体的任意位置插入目标片段,插入位点有无酶切位点都可以。因克隆方式为同源重组,因此片段与载体或片段与片段之间(多片段拼合时)的连接没有任何多余序列。克隆方式灵活,载体插入、删除、突变等试验都可以使用ClonExpress一步完成。

【常见问题】

1. 引物设计是否正确

2. 片段载体的DNA的量需要按照说明书要求加入(一定要跑胶检测浓度)

3. 插入片段PCR产物必须纯化(一定要去除dNTP)

4. 感受态效率要求107cfu/ug

【产品优势】

参见产品特点。一个全新的克隆系统,应用前景非常广阔

Mut Express

【简述】全新DNA定点突变系统

【特点】1. 独特的引物设计方式,指数扩增,PCR更容易进行

2. Phanta超保真扩增模块,扩增能力强,速度快,保真度高

3. ClonExpress重组环化系统,扩增产物体外高效环化

4. 应用灵活,可同时进行多位点突变,缺失、插入、删除等。

【改良原理】

组合了最先进的两套系统:phanta扩增系统和ClonExpress环化系统。独特的设计方式使PCR反应以指数方法高效进行。高效的重组系统使扩增产物在体外进行高效环化。两方面因素综合在一起,使得Mut

Express成为DNA定点突变的利器。

【常见问题】

1. 引物设计是否正确

2. 其他暂无

【产品优势】

全新的点突变系统,应用前景非常广阔。很便宜,进口试剂盒 7000,我们600…….

1. 高效单点突变

2. 高效多点同时突变

3.灵活的DNA操作(插入,缺失,重排等)

细胞生物学

Exfect Transfection Reagent

【简述】高效低毒的DNA转染试剂

【特点】1. 分子量均一阳离子聚合物,可高效转染

2. 细胞毒性低

3. 广泛适用于多种细胞的转染

【改良原理】

市售转染试剂可以分为三类:脂质体(Lipofectin),类脂质体(Fugene),阳离子聚合物 ,我们属于第三类。首先我们采用了特殊的合成方式,使得聚合物分子量均一,因此性质稳定,转染重复性好。其次,我们在-6-

聚合物的主链上引入了在生理条件下可降解的基团,使得聚合物在将DNA送入细胞后可迅速被降解,避免了聚合物积累而导致的细胞毒性。因此Exfect具有高效低毒的转染特性。

【常见问题】

1. 被转染DNA是否完整(需要高质量质粒DNA)

2. 细胞状态(状态差,转染效率差)

3. DNA与转染试剂比例(不同的细胞不一样,初次实验建议做梯度摸条件)

4. DNA包装过程应避免血清存在,而转染过程应在血清存在的条件下进行

【产品优势】

高效低毒(>=lipofectin2000),价格比lipo便宜不少

Annexin V FITC/EGFP Apoptosis Detection Kit

【简述】细胞凋亡检测试剂盒

【特点】1. 有效检测细胞凋亡

2. 对凋亡不同时期进行分类

【改良原理】

重组表达Annexin V,纯度高性质稳定。配合PI(核染料),可有效区分凋亡不同时期。

【常见问题】

1. 细胞状态(细胞状态差,自发凋亡比率会上升,导致背景较高)

2. 各步骤漂洗过程请充分进行,以降低染色背景

3. 磷脂酰丝氨酸含量低的细胞、组织无法使用(很少见)

【产品优势】

主要竞争对手BD

性质稳定,信噪比高,价格便宜

TUNEL FITC Apoptosis Detection Kit

【简述】细胞凋亡检测试剂盒

【特点】1. 有效检测细胞凋亡

2. 信噪比高(阳性信号强,背景弱)

【改良原理】

1. 重组可溶性表达TdT (TUNEL 主要用酶),活性高,性质稳定

2. 修改了dUTP的标记工艺,使得单位dUTP携带的荧光信号更高,因此阳性信号很强,信噪比高

【常见问题】

1. 细胞状态(细胞状态差,自发凋亡比率会上升,导致背景较高)

2. 各步骤漂洗过程请充分进行,以降低染色背景

其他问题暂无

【产品优势】

主要竞争对手Roche,Merck

性质稳定,信噪比高,价格便宜

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