2024年7月4日发(作者:)
NCBI_功能详细介绍
NCBI(National Center for Biotechnology Information,国家生
物技术信息中心)是一个提供生物医学和基因组学研究数据的资源库和数
据库。NCBI的主要目标是促进和推动生物医学研究的发展,并为科学家、
医生和公众提供相关信息。
NCBI提供了各种各样的数据库和工具,用于存储、检索和分析生物
医学和基因组学数据。下面是一些NCBI提供的主要功能的详细介绍:
2. GenBank:GenBank是一个基因序列数据库,存储了全球范围内的
基因序列数据。研究人员可以通过GenBank获得基因序列和相关信息,用
于基因功能研究、进化分析和生物信息学研究。
3. BLAST:BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种常
用的序列比对工具,用于比对给定的DNA、RNA或蛋白质序列与NCBI数据
库中的序列。BLAST可以帮助研究人员确定新序列的相关性,并找到与其
相似的序列。
4. Entrez:Entrez是一个综合性的引擎,可以对NCBI的不同数据
库进行全文。研究人员可以通过Entrez进行文献检索、基因和蛋白质注
释、序列比对等操作,方便地获取各类生物学数据。
5. PubChem:PubChem是一个化学物质数据库,存储了数百万种化合
物的化学结构和相关信息。研究人员可以通过PubChem化合物的属性、药
理学和毒理学数据,以及相关的文献信息。
6. OMIM:OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)是一个遗
传疾病数据库,提供了人类遗传疾病的基因和表型信息。研究人员可以通
过OMIM了解各种遗传疾病的发病机制、遗传模式以及相关基因的功能。
7. RefSeq:RefSeq是一个参考序列数据库,存储了各个物种的基因
组和转录组序列。RefSeq提供了基因的注释信息,包括基因的外显子、
内含子、启动子、终止子等区域的序列。
8. SRA:SRA(Sequence Read Archive)是一个存储高通量测序数据
的数据库,包含了各种测序平台产生的原始测序数据。研究人员可以通过
SRA获取不同物种的基因组、转录组和表观基因组的测序数据,用于后续
的生物信息学分析。
除了以上列举的主要功能外,NCBI还提供了许多其他相关的数据库
和工具,如ClinVar(遗传变异数据库)、dbSNP(单核苷酸多态性数据
库)、ViPR(病毒序列数据库)等,以支持科学家和研究人员在基因组学、
生物医学和生物信息学领域的研究工作。
总而言之,NCBI作为一个提供生物医学和基因组学数据的资源库和
数据库,为科学家、医生和公众提供了大量宝贵的生物学信息和研究工具,
推动了生物医学研究的发展,并为研究人员提供了全球范围的共享平台。
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