2024年3月15日发(作者：)

国产华大智造测序仪与进口illuminalife测序仪比较

目前在病原微生物鉴定的检测领域，各家单位主要使用的测序仪器厂

家和机型主要有华 大智造（MGISEQ-200、MGISEQ-2000）、

Illumina(Miseq、Ne某tseq 500 系列)和 Life(Proton、 S5)。

华大智造测序仪与 illumina、life 相比较，优势主要体现在以下几

个方面：测序原理和测 序质量、仪器产能和灵活性、仪器在临床检测上

的适用范围等几个方面，下面具体给老师展 开介绍以下。

一、测序原理和测序质量

图1：华大智造DNBSEQ技术特点

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Illumina 测序仪采用的是桥式 PCR 扩增技术，扩增时容易引入扩增

错误累积，导致测 序精确度降低；此外，Miseq 和 Ne某tseq 系列的测

序芯片为非阵列排布芯片，测序时 Cluster 在芯片上散乱的生长，相邻

Cluster 之间荧光信号容易相互干扰，影响测序质量和测序数据 产出。

Life 测序仪采用的是半导体测序原理，测序速度相对较快，但是建

库流程非常繁琐耗时； 半导体测序原理对连续 5 个以上相同碱基序列检

测不准确，导致整个测序质量比较低，对测 序结果影响很大。仪器产能

和灵活性

二、仪器产能和灵活性华大智造测序仪的测序芯片采用规则阵列芯片，芯

片利用率高，芯片

升级容易，数据量

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产出稳定。MGISEQ-200 测序芯片每个 RUN 可以产出 3 亿条 reads，

未来可拓展到产出 5 亿 条 reads 和 1 亿条 reads 两种规格的芯片。

MGISEQ-2000 测序芯片有两种规格，一种规格 可以每个 RUN 可以产出

18 亿条 reads，另外一种规格每个 RUN 可以产出 5.5 亿条 reads； 灵

活性更高。

Illumina 测序仪的测序芯片采用非规则阵列芯片，芯片利用率低，

数据产出不稳定。 Miseq 测序芯片每个 RUN 可以产出 2500 万条 reads，

Ne某tseq 有 1.3 亿条和 4 亿条两种规 格芯片。

Life 测序仪的测序芯片上的每个孔类似于一个极其微小的 pH 计，

芯片通量提升困难， 通量产出较低。每个 RUN 最多可以产出 8000 万条

reads； 三、仪器在临床的适用范围

图2：NMPA批准的测序仪三类医疗

图3：华大智造MGISEQ-200注册证

Illumina 测序仪注册证适用范围内容（详见图 4）：该产品用于人

脱氧核糖核酸 DNA 测 序,以检测基因变化,这些基因变化可能导致存在疾

病或易感性。该仪器在临床上仅限于与国 家食品药品监督管理总局批准

的体外诊断试剂以及仪器配套的随机软件配合使用，仅用于 胎儿染色体

21 三体、18 三体、13 三体的非整倍体检测，且不用于人类全基因组的

测序或 从头测序。

图 4： Ne某tseq-CN500 注册证

(备注：Ne某tseq-CN500 为贝瑞和康 OEM 报证机器，Illumina 的

Ne某tseq 500 机型未拿到 NMPA 注册证)

Life 测序仪注册证适用范围（详见图 5）：该产品通过半导体传感

器对核苷酸聚合反应 中的 pH 信号进行检测，用于人脱氧核糖核酸（DNA）

测序，以检测基因变化。该仪器在 临床上仅限于与国家食品药品监督管

理总局批准的体外诊断试剂以及仪器配套的随机软件 配合使用， 仅用于

胎儿染色体 21 三体、18 三体、13 三体的非整倍体检测，且不用于人

类全基因组的测序或从头测序。

图 5：Life 测序仪 DA8600 注册证适用范围

(DA8600 为达安基因 OEM 报证机器，Life 的 Proton 机型未拿到

NMPA 注册证)

四、华大智造品牌推荐

经过严格的市场调研，我们认为华大智造生产的基因测序仪是最优选

择，理由总结如下。

1.

华大智造测序仪NMPA审批应用范围无限制，应用范围为用于检测导

致疾病或易感性的基因变化（病原微生物鉴定、无创产前筛查、肿瘤相关

治病、耐药位点的检测、胚胎植入前染色体异常检测等），而其他获得

NMPA的仪器应用范围被严格限定为仅用于胎儿染色体的21三体、18三体、

13三体非整数倍体的检测。

2.

应用范围极为广泛，是一站式、开放式综合平台，可以进行未知物种

的全基因组测序、已知物种的基因组重测序、全外显子区域测序、转录组

测序、基因表达定量分析、染色质免疫共沉淀研究、小RNA测序、单细胞

染色体拷贝数变异检测、肿瘤相关基因位点基因检测等。

3. 华大智造测序仪在原理上具有独一无二的先进性，仪器采用了

DNA Nano Ball 测序技术（DNA 纳米球测序结构单元），该结构采用了

RCA 技术生成（单引 物线性滚环扩增技术）相比目前 illumina 公司的

Ne某tseq 系列测序仪采用的桥 式 PCR（指数扩增）大大减少了 PCR 扩

增过程中产生的偏好性和错误累积， 这使得该仪器对于单核苷酸变异检

测的精确度大大提升，助力精准医学的发 展。

4.

华大智造测序仪的核心元件，测序芯片 采用了先进的芯片规则阵列

排布 (Patterned array）技术，该技术是指在测序芯片上利用光化学腐

蚀等方法制造 了矩阵型规则排列的测序纳米孔，而 illumina 的 Ne某

tseq 系列的测序芯片则没 有采用矩阵纳米孔技术（Hiseq 3000/4000 系

列才开始使用矩阵型纳米孔）使 用矩阵纳米孔技术的 MGISEQ 测序仪和

未使用的 Ne某tseq 系统的光信号对比如 下（这一技术保证的 MGISEQ

测序仪的数据的高产量和高质量）

非矩阵纳米孔平台光信号图MGISEQ矩阵纳米孔光信号图