2024年4月6日发(作者:小米应用商店安装)
1. itraq的原理是什么?
Itraq的检测可以做这样的比喻,蛋白被打成肽段后,被平均的铺在了一个有384个
孔的平板上,然后机器会从每个孔中选取浓度在前5名的蛋白进行鉴定和比对,所以,如
果假设每个一个样本中有100个蛋白,他们的浓度均为1%,那么得到的结果就是蛋白的
得分低,但是鉴定的蛋白数量会很多,可以达到90以上;如果一个样本中有100个蛋白,
有3个蛋白的含量分别为30、20、10、其他的97钟蛋白为剩下的50%,那么这三种蛋
白的得分高,但是鉴定出的蛋白数量会比较少,也许只有50或者60个。因为一些高丰度
的蛋白会大量分部在上述的小孔中,抑制了其他蛋白的检出效果。
2. iTRAQ技术区别与以往二维电泳技术,具有如下优势:
2.1灵敏度很高,检测限较低,可检测出低丰度蛋白;
2.2高通量:同时对4-8个样本进行分析,提高实验通量,可同时对多个时间点或不
同处理的蛋白质进行分析;
2.3分离能力强,分析范围广,iTRAQ可以对任何类型的蛋白质进行分离鉴定,包括
高分子量蛋白质、酸性蛋白和碱性蛋白,膜蛋白和不溶性蛋白;
2.4结果可靠:通过高度敏感性和精确性的串联质谱方法,不需要凝胶,即可获得相对
定性与定量分析结果;
2.5自动化程度高:液相与质谱连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好。
由此可得,iTRAQ技术比二维电泳技术能发现更多数量和种类的蛋白,但在比较胞浆
蛋白及蛋白量的变化方面,二维电泳技术有一定长处,对iTRAQ的实验结果有互补作用。
3. LC/MS中蛋白处理是定量还是定性?
这是属于定量,需在蛋白定量后,各取相同量(50-100 ug)的蛋白(体积不大于25
ul,少于25 ul的用专用裂解液补至25 ul)进行还原化和烷基化。
4. LC/MS对需要检测的蛋白有量的要求吗?
有的,要求蛋白量最低50 ug,浓度最低要为5 ug/uL,否则同位素无法标记。
5. 数据分析中主要看哪些参数?
对于液质联用的数据分析,一般观察的参数为:Total Ion Score C.I. %(可信度)和
Tag-80/Tag-0(两样本的比值)。
6. 众多可信度数值中,主要选择哪些进行研究?
一般来说可信度在80%以上的均为可信程度非常高的。有些蛋白可信度在60%以上的
也可以作为参考数据。
7. 可信程度低于80%的数据有意义吗?
可信程度低于此值的,如果有感兴趣的蛋白可以通过ELISA、WB、Q-PCR、液态芯
片等技术手段进一步验证,毕竟LC/MS是研究蛋白组学的方法之一,如全面研究还是要综
合各种研究方法。
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