2023年7月26日发(作者：)

DNAstar-editseq⼊门篇⾸先是editseq的⼀些简单介绍EditSeq 是能够迅速、正确地输⼊，并且修改DNA 或蛋⽩质序列⼯具。每个EditSeq ⽂件都可以分为三个可编辑的部分，上边的⼀部分为序列⽂件，中间的⼀部分⾥是评论，底部是序列的注释。EditSeq 能读取⼤部分的序列格式——包括FASTA，GenBank，ABI、GCG 和ASCII 格式。你可以使⽤菜单命令或拖拽⽅式输⼊序列⽂件。另外，序列也许通过使⽤键盘输⼊，或者从其他地⽅复制、粘贴得到。经Entrez 或BLAST 检索得到的序列可以直接从因特⽹或企业内部互联⽹服务器下载。序列被打开后，EditSeq 能使⽤标准或者指定的遗传密码进⾏翻译，或者反翻译，寻找开放读框，还可以进⾏阅读校对。另外， EditSeq能以GenBank，FASTA和GCG 格式输出序列。⾸先从开始菜单打开主程序，选择DNAStar-editseq然后进⼊主程序点选File-open可打开所需分析序列如想打开序列1，那么双击进⼊序列，界⾯如下⾸先对于此DNA序列，我们很可能想分析其ORF，那么点选search-find ORF在弹出的对话框中点选find next后，⿊体标明的即是其第⼀个ORF也可继续点击Find Next 直到你把ORF 选定在所需位置，如继续点击find next后，得到第⼆个ORF得到例）即得到ORF 之后肯得到我们所需肯定想获得其需的蛋⽩序列其蛋⽩序列，列，是不是很点击Goodi ⽅便ies-translate D D NA（此处以以第⼀个ORRF 为除可⽅便查找ORF，利⽤search-find还可⽅便的对所需⼀段碱基进⾏定位，有时相当⽅便，如需在序列中查找attca这⼏个碱基所在位置，可进⾏find命令初次查找结果如图所⽰还可对特定位置序列进⾏定位，利⽤search-go to position命令，与上⽅法雷同，此处不⼀⼀赘述除了search功能，另⼀个⽐较好⽤的功能是goodies菜单，除上述介绍的translate DNA功能外，利⽤其reverse complement进⾏选定序列的反向互补转化，有时很有⽤在⼀新窗⼝出现转化结果，如图所⽰（也有reverse功能，⽅法类似，不赘述）Goodies-DNA statistics功能也很好玩，试试统计利⽤对测计结果如图所⽤speech-Proo测序单中碱基所⽰of-Read Seq 基），单击quence 可校正击后软件就开正测序单序列开始朗诵列中的错读（（⽼板经常性性提醒我去⼀个个对于序列的修改直接⼿⼯即可，⽂件输出保存就不⽤我说了吧，editseq就先介绍这么多，接下来简单介绍下megalign的简单⽤法，只介绍⼀些简单⽤法，详见另⼀贴